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BSA性状定位

产品简介

BSA(Bulked segregant analysis,BSA),也称混合分组分析法或集群分离法,是一种简单快速定位基因的方法。它是将目标性状表型极端的高、低两组个体的DNA分别混成DNA池,然后利用分子标记在两池中进行标记和性状间的关联分析。该方法适用于由单基因控制的质量性状或数量性状的主效基因定位。
随着高通量测序技术的兴起,基于全基因组重测序的BSA方法广泛地应用在粮食作物、经济作物、蔬菜花卉等物种中,并且成功定位出了许多农艺性状相关的基因。BSA作为当下最流行的基因定位方法,因其具有“快速、准确、经济、实用”的特点,正受到广大育种家的热烈追捧。

研究内容

基于比对分析发现的SNP、InDel标记,进行子代SNP、InDel频率差异分析,然后进行目标性状区域定位,最后进行候选基因提取和功能注释。

结果展示

送样建议

1) 亲本:目标性状在亲本间具有显著差异;

2) 子代混池:a、质量性状中混池规模以隐性个体数目为准,按照1:1混池;b、数量性状的表型值一般会符合正态分布,为保正基因定位结果精确性一般选择表型值为10%~20%的个体进行混池为宜。无论质量性状或者数量性状,混池规模建议在30+30以上;

3) 适用群体:a、纯合物种,F2、RILs、BC、DH等分离群体均可;b、杂合物种,一般使用F1群体;

4) 组织样和DNA质量要求与全基因组重测序相同。

010-80543251

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